Nybom, Hilde
Forsatt identifiering av päronsorter med hjälp av DNA-markörer
Merparten av de 57 svenska mandatsorterna av päron (48 sorter har hittills varit tillgängliga) kommer att identifieras med hjälp av åtminstone 4 (målsättningen är dock minst 8 loci om projektet får fortsatta anslag under 2009) mikrosatellit DNA-loci. Erhållna data (DNA profiler) kommer att utvärderas. När de är klara, kan de sedan läggas in i en databank för jämförelser med andra sortidentifieringar runt om i världen. Dessa DNA profiler kommer sedan att användas för att kontrollera att de olika klonarkiven i landet innehåller korrekt bestämda sorter, samt som jämförelsematerial när nyinventerade sorter ska bestämmas.
Bladprover kommer att analyseras med hjälp av minst 4 mikrosatellit DNA loci, med användande av protokoll som tagits fram på East Malling, England, och sedan vidare-optimerats på Balsgård. Erhållna bandprofiler bearbetas med ett speciellt datorprogram (redan tillgängligt på Balsgård och använt bl a i de tidigare genomförda äpple-analyserna), och läggs in i databanker för jämförelser med
motsvarande data för andra sortsamlingar runt om i världen. Se även bilaga.
De äldre päronträden på Balsgård har skötts om, och blad har samlats in från 29 av dessa som har mandatsortstatus. I tre fall stämde inte namnen till 100% med mandatsortlistan. För dessa tre samt för ytterligare 28 mandatsorter, som inte finns på Balsgård, har årsskott rekvirerats från de olika klonarkiven. Från 22 av dessa har vi fått årsskott. Dessa har sedan drivits i växthus, så att vi kunnat skörda blad. Dessutom har vi rekvirerat bladprover från 8 referenssorter i Brogdale-genbanken i England. DNA har isolerats från samtliga dessa prover. 12 primerpar för mikrosatellit-DNA analys har beställts, och PCR-reaktioner har hittills optimerats för 4 av dessa primers med utgångspunkt från protokoll framtagna vid East Malling, England. Erhållna bandmönster har jämförts med de bandmönster som referenssorterna har. De allra första screeningarna av hela materialet har just påbörjats.